Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a5Q63ZW6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a5Q63ZW6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms