Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vat1Q62465 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms