Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms