Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lcp1Q61233 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms