Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irf9Q61179 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms