Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4bQ61136 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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