Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf3Q60765 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms