Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms