Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms