Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc42Q5SV66 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms