Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms