Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms