Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms