Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms