Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms