Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC100530Q497J0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms