Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc185Q3V118 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms