Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms