Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rbm44Q3V089 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms