Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms