Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrfip1Q3UZ39 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrfip1Q3UZ39 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms