Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms