Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms