Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms