Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms