Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms