Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms