Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nom1Q3UFM5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms