Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms