Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms