Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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