Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms