Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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