Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml4Q3LRV9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms