Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdss1Q33DR2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms