Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms