Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lemd1Q14C37 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lemd1Q14C37 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms