Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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