Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b1Q148W0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b1Q148W0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms