Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Itgb8Q0VBD0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Itgb8Q0VBD0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Itgb8Q0VBD0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Itgb8Q0VBD0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Itgb8Q0VBD0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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