Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NeblQ0II04 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms