Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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