Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPINDOCQ05AH6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms