Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apoc2Q05020 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms