Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms