Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms