Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emx1Q04742 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emx1Q04742 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emx1Q04742 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Emx1Q04742 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx1Q04742 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx1Q04742 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx1Q04742 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms