Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms