Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms