Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms